ШҚТУ-да біріктірілген менеджмент жүйесі жұмыс істейді, оның ішінде:

• ISO 9001:2015 халықаралық стандартына сәйкес келетін сапа менеджменті жүйесі (СМЖ);
• ISO 37001:2016 халықаралық стандартына сәйкес келетін сыбайлас жемқорлыққа қарсы іс-қимыл менеджменті жүйесі (ЖҚМЖ);
• еуропалық жоғары білім беру кеңістігінде (ESG) сапаны қамтамасыз ету бойынша стандарттар мен ұсынымдар негізінде сапаны ішкі қамтамасыз ету жүйесі (СІҚЖ).

ШҚТУ БМЖ қолдану саласы мыналарға қолданылады:

• жоғары және жоғары оқу орнынан кейінгі білім беру саласында білім беру қызметтерін ұсыну;
• ғылыми зерттеулер мен ғылыми-өндірістік қызметті жүргізу;
• кәсіби даму бағдарламаларын іске асыру.

Сапа менеджменті жүйесі 2006 жылы жоғары оқу орындары арасында алғашқылардың бірі болып ШҚТУ-да енгізілді және сертификатталды. Бүгінгі күні ШҚТУ-да СМЖ халықаралық сертификаты, оның ішінде IQNet сертификаттау белгісі бар.

Университетте СМЖ шеңберінде Д. Серікбаев атындағы ШҚТУ СМЖ-не тән процестер айқындалған, анықталған және жіктелген процесс моделі әзірленді. /abouttheuniversity/qms/smk/processmap.aspx?lang=kz.

Университеттің СМЖ моделі бірнеше арнайы құралдарды қамтиды:

• Е-мониторинг жүйесіндегі негізгі процестердің тұрақты мониторингі.
• S- PORTAL-да электронды түрде ұсынылған білім беру процесі туралы ақпаратты жинау мен өңдеудің автоматтандырылған жүйесі.
• ПОҚ және университет қызметкерлерінің еңбегін ынталандыру (ПОҚ KPI және "ШҚТУ айының үздік қызметкері" конкурсы).
• ПОҚ мен қызметкерлерді оң өзгерістер процесіне тарту үшін "Кайдзенді" үздіксіз жақсарту стратегиясы.
• Сыртқы және ішкі тұтынушылардың қанағаттануын талдау.
• Сәйкессіздіктерді басқару, түзету және түзету әрекеттері.
• Ішкі аудит жүргізу. 
• Тәуекелдерді басқару.

2021 жылы ШҚТУ - да, ҚР жоғары оқу орындары арасында алғашқылардың бірі болып, ISO 37001:2016 халықаралық стандартына сәйкестікке сыбайлас жемқорлыққа қарсы іс-қимыл менеджменті жүйесі (ЖҚМЖ халықаралық сертификаты-Quality Austria) енгізілді және сертификатталды. IQNet сертификаттау белгісі де берілді.

ЖОО-да БМЖ бойынша Үйлестіру кеңесі жұмыс істейді, ол даму стратегиясын, сапа және сапаны қамтамасыз ету саласындағы саясат пен мақсаттарды айқындайды, процестерді басқаруды тиімді бақылайды.

БМЖ бойынша жұмыстарды үйлестіру, сондай-ақ СМЖ мен СІҚЖ-тің жұмыс істеуі мен қолдауы үшін Стратегия және сапаны қамтамасыз ету басқармасы жауап береді.

ЖҚМЖ жұмыс істеуі мен ұстап тұруы үшін Комплаенс қызметі жауап береді.

Университеттің барлық бөлімшелері тағайындалды:

• сапа қызметін тікелей басқаратын сапа жөніндегі уәкілдер;
• сыбайлас жемқорлыққа қарсы іс-қимыл бойынша жауаптылар;
• университет бөлімшелерінің тәуекелдерін басқаруды жүзеге асыратын тәуекелдер бойынша жауаптылар.

БМЖ құжаттамасына сапа бойынша басшылық, сапа және сапаны қамтамасыз ету саласындағы саясат, сапа саласындағы мақсаттар, ерекшелік, сыбайлас жемқорлыққа қарсы іс-қимыл саясаты, сыбайлас жемқорлыққа қарсы іс-қимыл саласындағы мақсаттар, сапаны Ішкі қамтамасыз ету жүйесі бойынша басшылық, құжатталған рәсімдер, ережелер, нұсқаулықтар кіреді. Аталған құжаттар білім беру порталының барлық пайдаланушыларына қолжетімді (https://www.do.ektu.kz/laws/index.asp).

Университетте бизнес-процестердің 95% автоматтандыруға мүмкіндік берген "Directum" электрондық құжат айналымы жүйесі жұмыс істейді.

Тұтынушыға бағдарлау қағидаты бойынша университетте көрсетілетін қызметтерді тұтынушылардың қанағаттанушылығын бағалау жүйесі жұмыс істейді:

• ЖОО аккредиттеу нәтижелерін және оның білім беру бағдарламаларын талдау;
• жоғары басшылықтың ЖОО студенттерімен және қызметкерлерімен жоспарлы кездесулерін, мектептердің, факультеттердің, топтардың жалпы жиналыстарын өткізу;
• талапкерлерге, білім алушыларға, түлектерге, оқытушыларға, жұмыс берушілерге және т.б. сауалнама жүргізу ;
• ұйымдар тарапынан түлектер туралы қалаулары мен пікірлерді талдау;
• әдістемелік өнім шығаруды талдау;
• тапсырыс берушілердің пікірлері, қабылдау-тапсыру актілері, ғылыми жарияланымдардың саны мен деңгейі бойынша ғылыми өнім шығаруды талдау. 

Атап айтқанда, университет деңгейінде жыл сайын сауалнаманың бірнеше түрі өткізіледі. Сауалнама материалдары сайтта ұсынылған (/abouttheuniversity/qms/svok/poll.aspx?lang=kz).

Халықаралық сертификаттау органдарының ISO 9001 және ISO 37001 стандарттарының талаптарына сәйкестігіне менеджмент жүйелерін сертификаттау олардың халықаралық талаптарға сәйкестігіне кепілдік береді, осы жүйелердің және жалпы университет қызметінің нәтижелілігі мен тиімділігін растайды.

Сапаны Ішкі қамтамасыз ету жүйесінің нәтижелілігі мен тиімділігі және оның еуропалық жоғары білім беру кеңістігінде (ESG) белгіленген талаптарға сәйкестігі ШҚТУ институционалдық аккредиттеуімен және мамандандырылған аккредиттеумен, оның ішінде халықаралық, білім беру бағдарламаларымен, сондай-ақ ұлттық және халықаралық рейтингтердегі ШҚТУ жоғары позицияларымен расталды.

ШҚТУ БМЖ-білім беру, ғылыми-зерттеу процестерінің және қолданыстағы және әлеуетті тұтынушылардың көз алдында кәсіби даму бағдарламаларын іске асыру процесінің сапасының кепілі. Нәтижелі және тиімді БМЖ-университеттің бәсекелестік артықшылығының негізі, нәтижесінде оның тұрақты қаржылық жағдайы.